La SEN-PNA est placée sous l’autorité d’un Directeur général nommé par décret, sur proposition du Ministre chargé de la Santé parmi les agents de l’Etat de la hiérarchie A ou assimilée.
Le Directeur général est assisté par un Secrétaire général qui le supplée en cas d’absence ou d’empêchement .
Le Directeur général assure l’administration générale de la SEN-PNA et veille à l’exécution des décisions prises par le Conseil d’Administration et les autorités de tutelle.
Il a la qualité d’employeur du personnel recruté au sens du Code du Travail. Il représente l’organisme en justice et dans tous les actes de la vie civile.
Le Directeur général fixe annuellement le projet de budget, le soumet au Conseil d’Administration, pour adoption. Il veille à l’exécution du budget, tant en recettes qu’en dépenses. Il produit trimestriellement, en cours de gestion, des états d’exécution budgétaire à présenter au Conseil d’Administration pour validation.
Le Directeur général a accès à tous les documents comptables. Il soumet annuellement au Conseil d’Administration un rapport de gestion faisant, notamment le point sur l’exécution du budget et des programmes pluriannuels d’actions et d’investissements. Il présente annuellement les états financiers commentés au Conseil d’Administration.